Sorge sulle alture del paese, in località “Lazzaretto”, così chiamata perché anticamente destinata al ricovero degli arcisatesi colpiti da malattie contagiose, in particolar modo la peste. L’edificio odierno risale ai primi decenni del XVIII secolo. Venne completato per volontà del prevosto don Pietro Antonio Alemagna per adempiere un antico voto della popolazione arcisatese, e consacrato nel 1738. Lo stesso prevosto Alemagna donò le reliquie del santo calabrese a cui era particolarmente devoto. L’edificio è una costruzione semplice, con campaniletto a vela. L’interno è un florilegio del barocchetto lombardo: sulle pareti, all’interno di elaborate cornici, sono dipinte alcune scene della vita di San Francesco da Paola, mentre il soffitto mostra eleganti illusioni architettoniche. La pala d’altare settecentesca rappresenta la Madonna della Cintura, circondata da San Rocco e San Gregorio Magno, intercedenti per le anime purganti.

Si giunge alla chiesa del Lazzaretto dal centro storico percorrendo la Via Crucis, costeggiata da cappelle ornate con scene in bassorilievo.